1647-ben a város Eisenstadt uralma alatt állt a hercegi Esterházy család, amely nagy hatással volt a város, és vezetett pozitív változásokat. 1648-ban, rendeletével Ferdinánd császár III Eisenstadt lett szabad város, adózik kifizetett összeg 16.000 forintot és 3000 hordó bort. 1670-ben I. Pál ülepedni hagyjuk Eisenstadtban és hat környező települések 3000 zsidót, akiket kiutasítottak Bécsben. Rabbi a város volt Vertaymer Samson, aki maga is temették el a régi zsidó temető.

Szükség volt a temetőben. Szóval ott volt a régi zsidó temető a 17. században a zsidó negyed közelében. Régi temető működött 1679-1875 években, és foglalkoztat mintegy 1140 sírkövek csak héber nyelvű feliratokkal. Mert korlátozott terület mellett, a régi temetőben jött létre az új. Egy új temető volt használatban, mivel 1875.

A náci megszállás alatt, mind a temetők részben megsemmisült, és a sírkövek használták az építőiparban a gát a város körül. 1945 után a temető felújított, és az emlékek kerültek helyükre. 1992-ben egy új temető vandalizmus történt: mintegy 80 sírkövek meggyaláztak náci szimbólumok.

Temető Eisenstadt eltér a többi ókori zsidó temetők hiányzik a növényzet. Azonban, ez nagyon hasonló alakú és megjelenésű a bécsi temető. Ez annak a ténynek köszönhető, hogy az első telepesek voltak a bécsi emigránsok. A bejárat előtt, a régi temetőben került sor a gyönyörű félköríves fém kapu, de most már nem maradt fenn. Mindkét temetők nyitva állnak a nyilvánosság előtt.