Régészeti Múzeum Eszék-ben alapították 1877-ben, és hívták a Múzeum a szabad királyi város, Eszék. A múzeum-ben alakult a kezdeményezésére és adományaiból (numizmatikai gyűjtemény, egy antik fegyvereket és irodalom) kereskedő Franjo Sedlakovicha. 1878-ban, az első múzeum kurátora nevezték ki Andrei Kodrik. Az első évtizedekben a múzeum tele kizárólag adományokból származó gazdag és neves polgárok a város Eszék, amely tartalmazza Franjo Sedlakovich Carl Nuber, Josip Juraj Strossmayer Emerick Hilda és Dr. Karl Kollich. Ez a gyűjtemény lett, és továbbra is a legnagyobb adomány a történelem, a múzeum.

Az egyik a híres kurátorok volt Vjekoslav Celestin - a múzeum kurátora 1893 óta. Dolgozott a múzeum közel 43 éves, volt egy szorgalmas munkás és profi. Ez megerősíti azt a tényt, hogy ő ismert múzeumok Horvátországban és külföldön. Fellépett a munka nagy részét: aggódik a befejezése és bemutatása a múzeum gyűjteményei végzett szisztematikus áttekintése dokumentáció, kezdve a régészeti lelőhely, és véget néprajzi anyag. Celestine munkájáért joggal tekinthető az egyik alapítója a múzeum. Végére hivatali ideje a kurátor 1933-ben megalapította a Régészeti Társaság Club "Moores" (1937-ben átnevezték a Baráti Társaság Régiségek "Moores"), ami jelentős mértékben hozzájárul a munka a múzeum.

Múzeum története során gyakran változtatta a helyét. És 1946 óta, és a mai napig ez az eszéki Citadella - egy egykori városi tanács.

A háború alatt a múzeum súlyosan megsérült, de szerencsére, a teljes gyűjtemény maradt szinte érintetlen. A legrosszabb kárt okozott az eső gyűjtését és a helytelen tárolás. Az állandó kiállítás vitték biztonságos helyre. De közben a folyamatos bombázás, a munkát a múzeum felfüggesztésre került. 1994-ben, a múzeum státust kapott egy nemzeti intézmény.