A történelem a székesegyház-bazilika Szent Szaniszló és Vladislav nyúlik vissza, a XIII században. Eredetileg a templom lábánál állt a Várhegy, és feltehetően hívták Mindaugas székesegyház. Van egy nagyon érdekes elmélet, amely szerint halála után Mindaugas, a templom vált egy pogány templom. Ezután a templomot lerombolták, majd újjáépítették újra a nagyherceg Jagelló.

Az új templom épült gótikus stílusban az akkor népszerű, a vastag falai volt 1, 4 méter. Székesegyház Jogaila azonban azt is fel volt készülve a kemény életet. Ez égett a tűz, de egy idő után ismét helyreállt Duke Vytautas, ezúttal a templom teljes egészében a kő.

100 év után megépítése után a székesegyház szükséges javításokat, és úgy döntöttek, hogy újjáépítsék teljesen. 1552-ben, vezetése alatt egy tehetséges építész Annus kezdett dolgozni a rekonstrukció, hanem azokat végéig nem volt, hogy legyen. Az épületet ismét leégett a tűz 1530. És nem ez volt az utolsó eset, amikor a katedrális szenvedett a tűz.

Egy másik rekonstrukció a katedrális kezdődött 1534-ben már. Ebben az időben, a projekt vezető építész által meghívott Rómából Bernardo Zanobi. De megint csak nem azt jelentette, hogy az ügyet a befejezésig. Egy másik tűz 1539-ben ismét hamuvá még nem fejeződött be katedrális. Azonban 1545 boltívek a templom épült irányítása alatt építész Giovanni Zini.

Az új templom épült építészeti stílusában a reneszánsz, és befejeződött a 1557, de a tűz 1610-ben megfordult a sok éves munkát a hamu. Azonnali felújítási munkák a székesegyház késett több mint 20 éve. A tűz után kezdett újabb átszervezése a székesegyház, épült együtt kápolna Szent Kázmér, amelyeket később temették emlékei a szent kanonizált idősebbik. Azonban ismét a tűz 1639-ben elpusztították a székesegyház, melyet hamarosan újjáépítették.

Abban az időszakban, 1655 által 1660 Vilnius elfoglalták a szovjet csapatok, és a templom alá, pusztítás és fosztogatás. Minden évben, hogy Vilnius uralták az orosz csapatok, az egyház nem jár. Mivel 1666 vége után aktív ellenségeskedés, a helyreállítás a templom irányítása alatt a híres olasz építész, aki felelevenítette a templom barokk stílusban.

Egy évszázaddal később, a templom felújított újra, de 1769-ben feltűnt a déli toronyba, ami szintén szükségessé tette, hogy rekonstruálni. Honnan 1777-1792, és a templom zárva volt felújítás, tartott a tervezetről Laurynas Gucevičius. Befejezése után a rekonstrukció a templomban szerzett klasszikus stílusban. Ez annyira láthatjuk, hogy napjainkban.

1921-ben, a katedrális megadta a címet Bazilika, tette Benedek pápa II. Bármennyire sors készített közgyűlés és teszteli a víz. A hatalmas áradások 1932-ben elöntött pincék a templom, ami miatt van szükség nagyobb javítások. 1949-ben, a katedrális zárva volt. Ezt követően ment még egy fosztogatás és 1956-ban kezdte meg működését a templomban Művészeti Galéria és helyreállították antik orgona. 1981-ben felújították a belső a templomban, visszaadták a festészet és a Templom eszközök.

A február 5, 1989-ben szentelték a székesegyház és visszatért a hívők. Ma ez a legfontosabb katolikus templom az országban. A pincében a katedrális vannak eltemetve megtiszteltetés politikai és vallási vezetők. A székesegyház nyitva áll a látogatók minden nap, és akkor is látogasson el és a Mass tartott a templomban.