Állatkert és a Museum of Nature Split ajándékaként került a város miatt a XX században, több értékes természeti gyűjtemények. Professzor Umberto Dzhirometta 1923 felvetette a kérdést létre a Természettudományi Múzeum. A városi tanács Split vette az ügyet a véleményét, és 1924-ben megalapította az első múzeum és Dzhirometta lett a vezetője haláláig, 1939-ben.

Az első éves fennállása, a múzeum található, az egyik az önkormányzati épületek a város központjában. Hamarosan a tér nem volt elég, és a múzeum költözött az egyik épület a park Marjan. Együtt a múzeum nyílt egy kis állatkert, ami egyes fajok a hazai és egzotikus állatok. Az első a volt Jugoszlávia Akvárium mellett az épület a múzeum épült további helyet. Néhány évvel később, a Oceanárium zárva volt, és alakították át egy kis ketrecben. Ma Split Állatkert több mint 300 állatfaj.

Az épület a park Marjan az ellenségeskedések 1991-ben bezárták, biztonsági okokból. Ezután a múzeum költözött a várba Gripe, és 1997 után tért vissza Marian. 2000 után, kérésére a munkavállalók igényeit a Múzeum osztottak egy új helyet, a teljes terület mintegy 1156 négyzetméter, amelyben a múzeum kezdett dolgozni 2002 januárjában.

Megnyitása előtt az új múzeum igazgatója átszervezték a múzeumi gyűjtemények és elmesélte több új kockázatok (pl gyűjteménye kitömött állatok és madarak, a tanszék Földtani és Őslénytani, rovartan, Department of gerinces és gerinctelen, stb). Is végeztek munkát a feldolgozás és rendszerezése a kiállításokat, terepmunka középső részén Dalmáciában, számos kiállítás a múzeumban, és azon kívül is. Ezen kívül a múzeum munkatársai részt vesz számos tudományos konferenciákon.

A földszinten a múzeum ad otthont a különböző kiállításokon, és a többi emeleten a ház állandó kiállítás. Bárki lehet vásárolni a múzeum további anyagot a történelem, a múzeum és a helyi természetrajz.